آموزش کار بر روی داده ها و تحلیل داده ها بوسیله Galaxy Servers

در مورد توالی نسل بعدی و استفاده از پلتفرم آنلاین بیاموزید و تجزیه و تحلیل داده های استفاده از مجموعه داده ها را در تحقیقات انجام دهید

عنوان اصلی : Hands On Next Generation Sequencing Using Galaxy Servers

سرفصل های دوره :

ngs مقدمه:
توالی نسل بعدی
شرکت های برتر که فناوری توالی را ارائه می دهند
نسل اول توالی
نسل دوم توالی
نسل سوم توالی
نقاط قوت و محدودیت توالی نسل بعدی
مسابقه NGS برای دانش شما
گردش کار NGS
عواملی که باید هنگام انتخاب فناوری توالی نسل بعدی (NGS) در نظر بگیرید
انتخاب فناوری خود برای NGS؟
پایگاه داده NCBI SRA:
پرونده SRA
پرونده های BAM/SAM
پرونده های cram
پرونده SFF
تفاوت قالبهای B/W
Server Galaxy:
Galaxy Server and Objects
سکوی کهکشان برای زیست پزشکی قابل دسترسی ، قابل تکرار و مشارکتی
ورود به کهکشان
ابزارهای تجزیه و تحلیل داده های NGS
دریافت SRA از پایگاه داده ها و سیستم عامل
ژنوم NCBI به کهکشان
ورود SRA به کهکشان
ابزار FASTQC به مجموعه داده های تولید شده
ابزار trimmomatic در مجموعه داده
نقشه برداری تراز/ژنوم
ابزار تخمین فراوانی در مجموعه داده ها
مسابقه ابزار که استفاده کرده اید :)
از مقادیر تا تصاویر (نقشه گرما)
یک نقشه گرما ایجاد کرده و ارسال کنید